Новости

Ученые из ИТЭБ РАН разработали быструю и чувствительную методику выявления ДНК на основе микрочипов

11 октября 2019 Рубрика: Исследования и разработки, Новости организаций Ключевые слова: биотехнологии, биомаркеры, ПЦР, диагностика

Коллектив авторов из ИТЭБ РАН представил в сентябрьском номере журнала Analytical Сhemistry альтернативную методику быстрого высокочувствительного определения фрагментов ДНК.

Фрагменты ДНК могут являться специфичными биомаркерами. Например, для инфекций — патоген или паразит, который вызывает инфекционные заболевания, имеет свойственные только ему последовательности ДНК. Для наследственных заболеваний человека также определены изменения последовательности ДНК, которых нет у здоровых. Поэтому очень актуально анализировать специфические фрагменты ДНК.

Полимеразная цепная реакция является классическим способом, золотым стандартом анализа фрагментов ДНК (ПЦР-диагностика). Но у методики ПЦР есть определенные недостатки: это достаточно длительный и чувствительный к присутствию в образце мешающих примесей процесс. Если бы удалось создать процедуру, свободную от этих недостатков, но обладающую сходной высокой чувствительностью, то новый метод был бы востребован, в частности, в медицинской диагностике.

«Наш метод основан на использовании технологий, которые были ранее разработаны для иммуноанализа на белковых микрочипах. В данной работе аналогичные технологии были применены для анализа ДНК, — сообщил соавтор статьи, заведующий Лабораторией наноструктур и нанотехнологий Института Теоретической и Экспериментальной Биофизики РАН, кандидат химических наук Юрий Шляпников. — Однако значительную часть работы пришлось делать заново, т.к. у молекул ДНК совершенно другая химия, и, например, для того, чтобы иммобилизовать олигонуклеотиды на специальной подложке, необходимо было создавать новую технологию».

В результате был сконструирован микрочип, на котором химически привязаны кусочки ДНК, специфичные к тем последовательностям, которые необходимо уловить. Впервые для нового метода диагностики была применена проточная микроячейка особой конструкции, позволяющая собирать фрагменты ДНК из потока образца на микрочипе в электрическом поле. Магнитные метки позволяют быстро детектировать пойманные на микрочипе фрагменты ДНК.

Альтернативный метод показал чувствительность, близкую к чувствительности ПЦР — несколько тысяч молекул, но, в отличие от ПЦР, значительно сокращено время проведения анализа — до 10 мин.

Работа поддержана Стипендией Президента.

Пресс-служба ИТЭБ РАН

Добавить комментарий

  • 28
  • 29
  • 30
  • 31
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 7
  • 8
  • 9
  • 10
  • 11
  • 12
  • 13
  • 14
  • 15
  • 16
  • 17
  • 18
  • 19
  • 20
  • 21
  • 22
  • 23
  • 24
  • 25
  • 26
  • 27
  • 28
  • 29
  • 30
  • 1